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Bonjour, c’est Fabrice pour votre Point fort du jour.

Aujourd’hui, on va parler de caca. Rien de scatologique: il se trouve que nos selles contiennent des bactĂ©ries indispensables Ă  notre bonne santĂ©. Mais nos modes de vie ont rĂ©duit la biodiversitĂ© de ce microbiote.

Des chercheurs suisses veulent la protĂ©ger en rĂ©coltant des Ă©chantillons partout dans le monde, pour les conserver dans une banque qui n’a rien Ă  voir avec Credit Suisse.

photo journaliste

Fabrice Delaye, Torgon (Valais

23.03.2023

Avant d'entrer dans le vif

🌎 Le rachat de Credit Suisse, une aubaine pour le climat? … Ou la naissance d’un monstre climaticide? L’avis d’Eric Jondeau, professeur de finance Ă  HEC Lausanne.

đŸ‡ș🇩 En 1941, un monstrueux massacre de juifs Ă  Kiev fait dĂ©marrer l’Holocauste. Ou comment l’Ukraine, avec Babi Yar, a connu un des Ă©pisodes les plus tragiques de la «Shoah par balles».

⚔ Quelqu’un se soucie-t-il du profil politique des soldats suisses? Michel Huissoud, fin connaisseur des rouages de Berne, se demande s’il faudra se garder de nos gardiens.

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Pourquoi la Suisse crée la banque mondiale des excréments

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PrĂ©servĂ© du mode de vie occidental, le microbiote de certaines populations d’Amazonie est deux Ă  trois fois plus riche que celui des habitants des pays dĂ©veloppĂ©s. | Microbiota Vault / Oscar Noya

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Notre intestin héberge naturellement des milliers de milliards de micro-organismes: le microbiote intestinal.

Mais nos modes de vie occidentaux ont diminuĂ© la biodiversitĂ© de ce microbiote, par rapport Ă  certaines populations comme les Yanomami d’Amazonie.

Des scientifiques suisses (UNIL, UZH EPFZ) sont en pointe pour conserver ce qu’il reste de cette biodiversitĂ©, dans une banque dĂ©diĂ©e.

 🚹 Ils sont au cƓur du documentaire scientifique L’Extinction invisible prĂ©sentĂ© prochainement en Suisse, qui raconte cette quĂȘte pour sauver ce qu’il reste de la diversitĂ© des micro-organismes de nos intestins.

De quoi on parle.

Le microbiote est l’ensemble des bactĂ©ries qui vivent en symbiose avec les ĂȘtres humains. Beaucoup sont dans les intestins, mais on en trouve aussi dans le vagin, les poumons, la bouche ou sur la peau.

L’importance de ce microbiote pour notre santĂ©, et son rĂŽle dans le dĂ©veloppement de certaines maladies, est de mieux en mieux mis en Ă©vidence, mĂȘme si les dĂ©monstrations dĂ©finitives sont encore rares.

Deux exemples:

 🇳🇮 Une Ă©tude norvĂ©gienne a Ă©tabli un lien clair entre la bactĂ©rie Helicobacter pylori et l’asthme. Les personnes obĂšses porteuses de cette bactĂ©rie semblent beaucoup moins susceptibles de faire de l’asthme.

 đŸ‡ș🇾 La chercheuse amĂ©ricaine Cathryn Nagler a aussi Ă©tabli un lien entre l’augmentation des allergies alimentaires et la perte de nos microbes «ancestraux», par abus d’antibiotiques.

L’extinction invisible. Nos modes de vie de mĂȘme que la surutilisation d’antibiotiques diminuent la biodiversitĂ© de notre microbiote.

 🇹🇭 La conserver, la protĂ©ger et l’étudier sont les raisons d’ĂȘtre de l’initiative de banque du microbiote: le Microbiota Vault, hĂ©bergĂ© en Suisse.

 đŸŽ„ Sarah Schenck, corĂ©alisatrice et productrice du documentaire The Invisible Extinction:
«Au cours des 50 derniĂšres annĂ©es, l’humanitĂ© a perdu 50 % de son microbiote ancestral.»

 🏱 Cette disparition est nettement plus marquĂ©e dans les pays dĂ©veloppĂ©s et fortement urbanisĂ©s.

 🌮 En 2015, une Ă©tude pilotĂ©e par la chercheuse amĂ©ricaine Gloria Dominguez-Bello identifiait le plus haut niveau de biodiversitĂ© du microbiote intestinal jamais observĂ©e dans une communautĂ© yanomami, sans contact connu avec le monde occidental.

 🏩 C’est ce qui a conduit Gloria Dominguez-Bello et son collĂšge Martin Blaser Ă  imaginer en 2018 un consortium international pour collecter des selles, afin de protĂ©ger et Ă©tudier la biodiversitĂ© menacĂ©e qu’ils contiennent.

Adrian Egli, directeur de l’Institut de microbiologie mĂ©dicale de l’UniversitĂ© de Zurich, a Ă©tĂ© contactĂ© il y a deux ans pour rejoindre ce consortium:

«Ils connaissaient et appréciaient la Suisse en particulier pour ses ressources scientifiques et ont choisi notre pays pour installer le Microbiota Vault.»

Le coffre-fort. AprĂšs une phase d’étude qui a conclu Ă  la faisabilitĂ© du projet, le Microbiota Vault est dĂ©sormais actif. En Suisse, il s’articule autour de trois groupes de scientifiques:

 đŸ‘©â€đŸ« A l’UniversitĂ© de Lausanne, le groupe de Pascale Vonaesch s’occupe plus particuliĂšrement de la collecte des Ă©chantillons avec des partenaires au Laos, en Éthiopie, au PĂ©rou, Ă  Puerto Rico ainsi qu’en Suisse (Ă  Fribourg), et des techniques de prĂ©servation

Six cents Ă©chantillons sont dĂ©jĂ  parvenus Ă  Lausanne. L’objectif est d’en collecter 2000 pour la phase pilote, et plus de 200’000 au total. Ils seront d’abord stockĂ©s Ă  Zurich et pourraient Ă  terme rejoindre un bunker de l’armĂ©e suisse.

 đŸ« A l’UniversitĂ© de Zurich, le groupe d’Adrian Egli s’occupe de caractĂ©riser les millions de bactĂ©ries prĂ©sentes dans ces Ă©chantillons.

 đŸ–„ïž A l’Institut de l’alimentation, de la nutrition et de la santĂ© de l’EPFZ, l’Ă©quipe de Nicolas Bokulich prĂ©pare la plateforme destinĂ©e Ă  partager les informations issues de l’étude des bactĂ©ries du Microbiota Vault au sein de la communautĂ© scientifique.

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On en avait parlé

Nutrition et immunitĂ©, comme cul et chemise. Serge Rezzi, directeur de l’Institut suisse des vitamines, explique dans cette interview pourquoi la relation complexe entre nutrition et immunitĂ© va gagner en importance.

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Chacun son microbiote. En analysant la diversitĂ© gĂ©nĂ©tique du microbiote de plus de 180 espĂšces animales sauvages, des chercheurs y ont dĂ©couvert des centaines de bactĂ©ries
 dont prĂšs de 75% Ă©taient totalement inconnues! Et si l’humain arrĂȘtait de se regarder le nombril?

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Au dĂ©but du coffre-fort. En 2020, Heidi.news se penchait sur les dĂ©buts en Suisse du projet de banque du microbiote inspirĂ© par la rĂ©serve mondiale de semences du Spitzberg, et de son projet d’acheter un bunker de l’armĂ©e suisse pour crĂ©er une rĂ©serve de milliards de micro-organismes.

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Il est temps de raconter le monde

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A voir ou lire

Le microbiote pour les nuls. Dans cette vidĂ©o PopScience, Heidi.news explique comment fonctionne le microbiote en s’aidant des crĂ©atures de Star Wars.

Heidi.news (accĂšs libre) (FR)

L’extinction invisible. De l’Amazonie aux Alpes suisses, le documentaire de Sarah Schenck et Steven Lawrence raconte l’urgence de la perte de biodiversitĂ© des bactĂ©ries qui vivent en symbiose avec nous, l’importance de ce phĂ©nomĂšne en santĂ© et les tentatives pour y remĂ©dier.

The Invisible Extinction (documentaire, streaming payant) (EN)

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